Aivotulehdus on yleensä viruksen aiheuttama aivokudoksen infektio. Pelätyimpiä ovat herpesvirus (HSV-1) infektiot, jotka reagoivat hyvin asikloviiri- hoidolle, mutta ilman kyseistä hoitoa sairaus johtaa usein kuolemaan. Muina aiheuttajina ovat punkkienkefaliitti-, entero-, sekä harvinaisempana flaviviruksen aiheuttama Japanin aivokuume, joka esiintyy Aasiassa ja johon on myös saatavissa tautia estävä rokote.

Suomalaisten sairastavuuden kannalta Japanin Aivokuume on merkitykseltään ollut vähäinen (ks. Japanin aivokuume). Oleskeltaessa sadekaudella Aasiassa sairastavuusalueella (maaseutu) on mahdollista ottaa kolmivaiheinen rokote Japanin aivokuumetta vastaan. Punkkiaivokuumetta (Kumlingen tauti) sen sijaan on esiintynyt maassamme merkittävästi (ks. Kumlingen tauti). Se syntyy punkin puremasta ja tautia esiintyy etenkin Suomessa rannikkoseudulla sekä saaristossa, useita kymmeniä tapauksia vuodessa. Tauti on viime vuosina lisääntynyt punkkien myötä. Punkkienkefaliitin eli punkkiaivokuumeen varalle on nykyisin olemassa rokotus. Valtaosa aivokuumeen saaneista paranee, mutta osalle jää pysyviä oireita ja osa ihmisistä menehtyy infektioon.